Шутливое: ясно только одно — что ничего не ясно.
Говорят, разводя руками, когда разобраться не вышло: пропали деньги, сломалось неизвестно отчего, история запуталась в пересказах. Присловье снимает неловкость и заменяет признание «я не понял».
Кто это подписал, никто не помнит. Дело ясное, что дело тёмное.